docker瞬間佈署reverse proxy還有SSL認證
標題不呱張，真的只要設定好，一切都是瞬間就完成了不過好難一語道盡這文章要講的內容喔各階段的方法要全部用上才會體現他的價值一旦設定好之後，基本
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Pull request 與其自爽不如貢獻開源
前言只要是軟體工程師這個領域內的職業都一定需要經營自己的side projectside project等於自己的職涯作品集，應徵時絕對會需要拿出來展示的項目以前寫過一篇關於生物資訊工程師要經營side project可以往哪些方向其中一
2023-11-14
Nextflow平行與合併處理
前言這篇文章是爲了自己要學習幾個Nextflow的重要功能而寫的並寫一個程式實踐這些功能
Nextflow的基本概念會跳過不講可以參考我之前寫的文章快速了解或是看官方文件
Nextflow教學 - 以最小可行專案為例
2023-08-06
NT FASTA近億等級數量索引
情境說明，自己玩的專案中需要建立NT資料庫並且需要經過資料清洗，像是將資料庫分成human和non human的fasta並將無taxon分類的sequences排除可怕的是目前的NT的序列數已達到9400萬條
策略是先遊歷一遍整個檔
2023-07-06
記憶體插滿4條無法開機
這篇是成功案例，但每次更換電子零件都是場賭注如果更換完按下開機鍵有不如預期的狀況真的很想死
先講結論，調整記憶體電壓就成功了，但要發現是電壓問題…
2023-06-12
台灣文蛤是新種?怎樣算新種?
前言最近的一個新聞報導臺灣人常吃的蛤蜊原來是全新的物種以前都一直以爲是1920年代引進到台灣的麗文蛤，經過水試所研究人員研究發現是不同於該物種的全新種
2023-04-17
Makura v1.2.0 更新說明
Makura的功能介紹可以看上一篇
Makura安裝與使用 - 批量下載NCBI genomes
pip install makura==1.2.0
這篇介紹1.0.0到1.2.0之間增加的功能和修復的bug
2023-03-19
2023更新至docker 23.0.1的問題
更新docker之後容器都暫停並出現以下錯誤
docker-compose up -d
Starting hexo-app ... error
ERROR: for hexo-app Cannot start service app:
2023-03-08
2022 Review雞腸道菌相分析方法
研究雞的腸道菌相除了要做基礎研究外，大多是為了提升生長和生產表現以及減少對抗生素依賴來看看近幾年的相關研究的菌相分析方法以及分析流程會使用到哪些工具
2022-12-19
Makura安裝與使用 - 批量下載NCBI genomes
Introduction目的是要一次大量下載NCBI的assembly genomeQ：這種需求什麼時候會用上呢？A: 生物資訊分析genomics或metageomics資料常會需要下載指定物種或是所有屬於微生物的genomes
2022-12-12
No space left on device - Too many files in a single directory
最近從NCBI下載大量的genome fasta到硬碟的單一目錄下到16000左右的時候就跳出類似下方的錯誤訊息
mv: cannot move ‘/soure/genome.fna.gz’ to ‘/d
2022-12-02
自製NFC電子名片
Introduction啟發是看到有人在賣客製化的NFC感應名片
碰卡-高質感的電子名片
拿出卡片讓對方用手機NFC感應之後就能看到你的資訊所謂資訊就是一個網址對方只是可以不用手動輸入網址方便進入網站而已
DIY首先要
2022-11-26
Nextflow教學 - 以最小可行專案為例
Introductionworkflow framework要學嗎？其實也不一定要，自己用python之類的自刻一套完整有邏輯的workflow framework（之後簡稱WF）也行
只是想說104上面一堆公司都在那邊最好要會Nextf
2022-11-20